Informácie

Open source softvér na analýzu variability srdcovej frekvencie (HRV)

Open source softvér na analýzu variability srdcovej frekvencie (HRV)



We are searching data for your request:

Forums and discussions:
Manuals and reference books:
Data from registers:
Wait the end of the search in all databases.
Upon completion, a link will appear to access the found materials.

Variabilita srdcovej frekvencie (HRV), zmena v časových intervaloch medzi susednými srdcovými tepmi, je novou vlastnosťou vzájomne závislých regulačných systémov, ktoré fungujú v rôznych časových škálach, aby sa prispôsobili výzvam a dosiahli optimálny výkon (Shaffer et al., 2014).

Laicky povedané, HRV je mierou úsilia a námahy, či už fyzickej alebo duševnej. Časové intervaly medzi priľahlými údermi srdca, tiež označované ako RR intervaly, NN intervaly alebo InterBeat Intervals (IBI), sa určujú na základe špičkových hodnôt vo fyziologických signáloch. IBI je možné stanoviť buď elektrokardiogramom (EKG), alebo fotopletyzmografiou (PPG; Madea et al., N.d .; pozri obrázok 1).
Obrázok 1: Obrázky EKG (hore) a PPG (dole) a vyznačené intervaly.

S týmito IBI je možné vypočítať rôzne metriky HRV. Tieto metriky je možné rozdeliť na časovú doménu (napr. Priemer RR, SDRR), frekvenčnú doménu (napr. Vysoká a nízka frekvencia alebo HF/LF) a nelineárne metriky (prehľad pozri Shaffer a kol., 2004) . Analýza však nie je jednoduchá, vyžaduje si však zložité výpočty.

Aké voľne dostupné softvérové ​​balíky umožňujú ľahký výpočet týchto metrík?


Referencie

Yuka Maeda, Masaki Sekine, Toshiyo Tamura, Koichi Mizutani (n.d.). Vyhodnotenie PPG zeleného svetla v parametroch variability srdcovej frekvencie.

Shaffer, F., McCraty, R. a Zerr, C. L. (2014). Zdravé srdce nie je metronóm: integrovaný prehľad anatómie srdca a variability srdcovej frekvencie. Hranice v psychológii, 5, 1040.


Existuje množstvo balíkov, ktoré umožňujú výpočet týchto metrík. Tieto balíky popíšem podľa kategórie:

Softvér

  • Kubios je program z Fínska, ktorý má pekné grafické používateľské rozhranie, do ktorého môžete importovať údaje EKG alebo IBI (nie PPG) a vypočítať všetky metriky. Podporujú rôzne formáty súborov, ale môžete importovať akýkoľvek iný textový súbor s niektorými ďalšími špecifikáciami (napr. Časové indexy). Tento softvér umožňuje napríklad niekoľko nastavení na filtrovanie a umožňuje vám jednoduchú segmentáciu a analýzu údajov. Dávkové analýzy však nie sú možné, takže všetky kroky je potrebné zopakovať pre každý subjekt.
    Pozn. Web bol práve tento týždeň offline. Softvér (pre Mac OS aj Windows) si však stále môžete stiahnuť. Pingnite mi na terminál Axon a pošlem vám odkazy.
    *Pozn. Kubios teraz odkazuje na stránku na Facebooku. Aktuálne pracujú na novom vydaní. *
  • gHRV je implementovaný v Pythone a funguje s GUI (webová stránka). Prijímajú sa niektoré typické formáty vrátane IBI v textovom formáte ASCII. Nemôže však čítať časové indexy. Program preto nebude vedieť, či alebo kedy boli zmeškané R-vrcholy a následne IBI (porovnajte skutočné údaje v Kubiose a načítanom gHRV). Interpolácia a časová, frekvenčná a nelineárna analýza sú možné.

Python

  • gHRV je možné použiť aj v samotnom Pythone so zdrojovým kódom. To vám poskytne väčšiu flexibilitu a umožní vám dávkovú analýzu vašich údajov. Toto sa mi však nepodarilo otestovať.
  • hrv je modul, ktorý v súčasnosti vyvíja Rhenan Bartels. V súčasnosti sú možné iba jednoduché analýzy v časovej oblasti, ktoré dobre fungujú s kompletnými súbormi údajov IBI. V okamihu písania Rhenan vyvíja analýzu frekvenčnej domény a implementuje spôsob interpolácie chýbajúcich údajov. Je otvorený aj návrhom, ak potrebujete konkrétnu funkciu.

R.

  • RHRV je kompletný balík R, ktorý organizuje údaje štruktúrovaným spôsobom. Musíte importovať IBI alebo časové indexy úderov (alebo niektoré súbory špecifické pre zariadenie), po ktorých sa dajú vypočítať všetky metriky. Existujú aj metódy filtrovania a v prípade potreby umožňujú ľahké ručné odstránenie odľahlých hodnôt v grafickom rozhraní. Balíček je dobre zdokumentovaný a existuje niekoľko video návodov.

Matlab

  • Softvér na analýzu HRV (HRVAS)

    je nástroj na analýzu variability srdcovej frekvencie (HRV) vyvinutý pomocou programu MATLAB. HRVAS dokáže znehodnotiť a filtrovať IBI a môže vykonávať časovú doménu, frekvenčnú doménu, časovú frekvenciu, Poincare 'a nelineárnu analýzu HRV (z webovej stránky).


Pozri si video: Airodis Software: Adding and Configuring a Station (August 2022).